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Promotionsstelle in Computational Biology und Deep Learning

Job

  • Level
    Junior
  • Ort
    Hamburg
  • Arbeitsmodell
    Onsite
  • Job Feld
    Data
  • Anstellung
    Teilzeit
  • Vertragsart
    Befristetes Dienstverhältnis
  • Gehalt
    63.600 bis 91.100€ Brutto/Jahr

Job Zusammenfassung

In dieser Position entwickelst du Machine-Learning-Verfahren zur Analyse und Integration von Spatial Omikdaten, um molekulare Heterogenität bei Nierenerkrankungen zu erforschen und klinische Zusammenhänge herzustellen.

Job Technologien

Deine Rolle im Team

  • Sie entwickeln computergestützte und maschinelle Lernverfahren, um Spatial Omikdaten unterschiedlicher Auflösungen und Technologien zu analysieren und zu integrieren, die Gewebeorganisation zu charakterisieren.
  • Außerdem ist ein Ziel datengetrieben, die molekulare Heterogenität von Nierenerkrankungen herzuleiten und mit klinischen Messgrößen in Beziehung zu setzen.
  • Je nach Hintergrund und Interesse liegt der Schwerpunkt Ihres Projekts entweder auf der Integration und Analyse räumlicher Omikdaten oder auf Deep-Learning-Methoden, die die höherdimensionale Struktur von Gewebe nutzen; beide Richtungen sind im Verbund eng miteinander verknüpft.
  • Die Methoden werden auf einer gut charakterisierten Kohorte humaner Nierenbiopsien angewendet, gemeinsam mit unseren Partnern evaluiert und als Open-Source Software veröffentlicht.
  • Sie präsentieren Ihre Ergebnisse auf internationalen Konferenzen und publizieren in begutachteten Fachzeitschriften.
  • Diese Position ist mit 65 % der regelmäßigen wöchentlichen Arbeitszeit für 36 Monate befristet zu besetzen und soll zum 1. Januar 2027 (oder zum nächstmöglichen Zeitpunkt) besetzt werden.

Unsere Erwartungen an dich

Ausbildung

  • Abgeschlossenes Masterstudium (oder gleichwertig) in Bioinformatik, Informatik, Computational Biology, Physik, Mathematik, Statistik oder einem verwandten quantitativen Fach.

Qualifikationen

  • Solide Grundlagen in Statistik und maschinellem Lernen sowie Interesse an geometrischem oder topologischem Deep Learning, Graph Neural Networks oder verwandten Methoden.
  • Interesse an biomedizinischen Fragestellungen und Bereitschaft zur engen Zusammenarbeit mit Klinikerinnen und Klinikern sowie experimentell arbeitenden Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern.
  • Gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift; Deutschkenntnisse sind nicht erforderlich.
  • Selbstständige, sorgfältige und teamorientierte Arbeitsweise.

Erfahrung

  • Sehr gute Programmierkenntnisse in Python und Erfahrung mit den wissenschaftlichen Python Bibliotheken; Erfahrung mit Deep-Learning-Frameworks (PyTorch oder vergleichbar) wird vorausgesetzt.
  • Erfahrung mit Einzelzell- oder Spatial Omikdaten oder mit Computational Pathology ist von Vorteil, aber keine Voraussetzung.

Unser Angebot

  • Eine vollständig finanzierte Promotionsstelle in einem neu eingerichteten, BMFTR-geförderten Juniorverbund mit klar definiertem Forschungsprogramm und eigenen Mitteln für Reisen und Konferenzen.
  • Arbeit an aktuellen KI-Methoden mit direkter klinischer Relevanz.
  • Zugang zu umfangreichen multimodalen biomedizinischen Datensätzen und moderner GPU-Infrastruktur.
  • Enge Zusammenarbeit mit Klinikerinnen und Klinikern, Biologinnen und Biologen sowie KI-Forschenden in einem stark interdisziplinären Umfeld.
  • Möglichkeit zur Publikation in führenden internationalen Fachzeitschriften und auf Konferenzen.
  • Faire und transparente Vergütung nach unserem Tarifvertrag TVöD/VKA (63.600 € - 91.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufserfahrung.
  • Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld.
  • Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere.
  • Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik "UKE INside" in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten.
  • Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice.
  • Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote.
  • Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen.
  • Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander.
  • Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team.
  • Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den "Health Kitchen" Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände.

Benefits

Work-Life-Integration

Gesundheit, Fitness & Fun

Mehr Netto

Themen mit denen du dich im Job beschäftigst

Job Standorte

  • Standort Hamburg

    Deutschland

Das ist dein Arbeitgeber

UKE - Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf

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Wir sind das UKE. Die pulsierende Gesundheitsstadt inmitten von Hamburg. Wo so viel Energie in der Luft liegt und der Fortschritt den Takt angibt, ist kein Tag wie der andere. Über 11.000 Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter mit sehr unterschiedlichen Aufgaben eint hier das gleiche Ziel: das Wohl des Menschen.

Description

  • Unternehmenstyp
    Etablierte Firma
  • Arbeitsmodell
    Hybrid, Onsite
  • Branche
    Gesundheitswesen, Soziales
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Promotionsstelle in Computational Biology und Deep Learning

Gehalt
63.600 bis 91.100€ Brutto/JahrNetto aus dem Bruttogehalt im Inserat mit Steuerklasse I umgerechnet.39.388 bis 53.809 € netto/Jahr · Steuerklasse I
Ort
Hamburg
Arbeitsmodell
Onsite
Diversität
Für alle Personen geeignet (m/w/d)

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